Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hecw1Q8K4P8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms