Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pitrm1Q8K411 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pitrm1Q8K411 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitrm1Q8K411 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms