Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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