Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brd3Q8K2F0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms