Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim68Q8K243 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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