Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Nek9Q8K1R7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Nek9Q8K1R7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Nek9Q8K1R7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Nek9Q8K1R7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms