Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pkn3Q8K045 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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