Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LgsnQ8CIX8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LgsnQ8CIX8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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LgsnQ8CIX8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms