Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Csnka2ipQ8CH19 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Csnka2ipQ8CH19 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Csnka2ipQ8CH19 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Csnka2ipQ8CH19 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Csnka2ipQ8CH19 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Csnka2ipQ8CH19 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Csnka2ipQ8CH19 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Csnka2ipQ8CH19 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Csnka2ipQ8CH19 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Csnka2ipQ8CH19 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Csnka2ipQ8CH19 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Csnka2ipQ8CH19 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Csnka2ipQ8CH19 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnka2ipQ8CH19 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Csnka2ipQ8CH19 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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