Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms