Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms