Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc113Q8C5T8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms