Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C5C9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Q8C5C9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Q8C5C9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Q8C5C9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Q8C5C9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Q8C5C9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Q8C5C9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C5C9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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