Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms