Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snx22Q8C084 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snx22Q8C084 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms