Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim35Q8C006 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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