Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms