Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms