Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo38Q8BMI0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms