Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Atg4dQ8BGV9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Atg4dQ8BGV9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Atg4dQ8BGV9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Atg4dQ8BGV9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Atg4dQ8BGV9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Atg4dQ8BGV9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg4dQ8BGV9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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