Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem39bQ810L4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem39bQ810L4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms