Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cldn34b3Q80ZS5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Cldn34b3Q80ZS5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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