Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Lrfn4Q80XU8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Lrfn4Q80XU8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Lrfn4Q80XU8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrfn4Q80XU8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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