Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms