Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ell3Q80VR2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ell3Q80VR2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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