Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfap100Q80VN0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms