Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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