Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms