Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI0

Znf12, Zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf12Q7TSI0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf12Q7TSI0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms