Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PhkbQ7TSH2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms