Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms