Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms