Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp397Q7TNK4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms