Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf139Q7TMV1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms