Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms