Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms