Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms