Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smchd1Q6P5D8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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