Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ParpbpQ6IRT3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ParpbpQ6IRT3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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