Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Krt40Q6IFX3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Krt40Q6IFX3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Krt40Q6IFX3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Krt40Q6IFX3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Krt40Q6IFX3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt40Q6IFX3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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