Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms