Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms