Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca2Q6DIC0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca2Q6DIC0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms