Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc3c1Q6DFV6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc3c1Q6DFV6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms