Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pram1Q6BCL1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms