Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Papd5Q68ED3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Papd5Q68ED3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms