Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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Ccdc18Q640L5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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Ccdc18Q640L5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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Ccdc18Q640L5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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Ccdc18Q640L5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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Ccdc18Q640L5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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Ccdc18Q640L5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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Ccdc18Q640L5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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Ccdc18Q640L5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc18Q640L5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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