Protein–RNA interactions for Protein: Q62052

Oca2, P protein, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oca2Q62052 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Oca2Q62052 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms