Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rai1Q61818 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rai1Q61818 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rai1Q61818 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rai1Q61818 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rai1Q61818 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rai1Q61818 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rai1Q61818 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rai1Q61818 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rai1Q61818 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rai1Q61818 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rai1Q61818 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rai1Q61818 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms