Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cd47Q61735 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cd47Q61735 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cd47Q61735 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cd47Q61735 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cd47Q61735 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cd47Q61735 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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